Сергій народився 11 листопада 1984 року в місті Берестин на Харківщині. Навчався у Берестинському ліцеї №2 (раніше – Красноградська загальноосвітня школа №2). Опісля вступив до Красноградського професійного ліцею, де опанував спеціальність муляра, монтажника сталевих і залізобетонних конструкцій та електрозварника ручного зварювання.
Працював водієм у Берестині та Харкові. Згодом – у ТОВ «Берестинський млин». До роботи ставився відповідально, не уникав складних завдань.
У 2015 році одружився. Через рік у родині народилася донька Олександра.
У червні 2023-го Сергія мобілізували до лав Збройних Сил України. Після підготовки в навчальному центрі військової частини А1363 його направили до 118-ї окремої механізованої бригади, де він служив старшим розвідником розвідувального підрозділу.
Взимку 2024 року чоловік зазнав поранення. Після лікування та реабілітації в Дніпрі повернувся до служби.
Захисника нагородили відзнакою Міністерства оборони України «За поранення».
Поховали Сергія Меркулова на Центральному кладовищі в Берестині.
У нього залишилися дружина, донька, батько та брат.