Сергій народився 12 березня 1996 року в місті Нетішині Хмельницької області. В Національному університеті водного господарства та природокористування опанував професію електромонтажника силових мереж та електроустаткування. Працював у приватному акціонерному товаристві «Рівнеазот».
Коли почалося повномасштабне вторгнення, Сергій добровільно став на захист України. Служив у 31-му Чернівецькому прикордонному загоні імені генерал-хорунжого Олександра Пилькевича. Обіймав посаду інспектора прикордонної служби 3 категорії – снайпера 2 групи інспекторів прикордонної служби. Виконував службові та бойові завдання в найгарячіших точках Донецької, Луганської та Харківської областей. Мав статус учасника бойових дій.
«Сергій був працевлаштованим і мав бронь, але без вагань став на захист України, хоч до цього не мав досвіду навіть звичайної строкової служби. Склавши присягу, вирушив на схід. Перебував у найгарячіших точках фронту. Він пройшов крізь пекло. Він не боявся смерті, завжди ішов уперед, підтримував побратимів і ніколи не залишав інших у біді. Сергій був відповідальним і самовідданим, надзвичайно щирим, відважним, повним позитиву, з неймовірною силою духу та добрим серцем. Він завжди був готовий прийти на допомогу. Сергій заслуговує на вічну пам'ять і вдячність від українського народу», – написала мама воїна Людмила.
Сергія Пилипчука посмертно нагородили відзнакою «За честь і мужність».
Поховали захисника в рідному Нетішині.
У нього залишилися дружина, донька, батьки та двоє братів.