Сергій народився 6 вересня 1977 року в селищі Зачепилівка на Харківщині. Закінчив місцеву школу. Згодом здобув кілька професій, проходив курси та підвищував кваліфікацію. Працював у Зачепилівському автодорі. Був працьовитим, відповідальним і справедливим, завжди допомагав іншим. У вільний час любив рибалити. Найбільшою цінністю в його житті була донька.
Під час повномасштабної війни служив у лавах Національної гвардії України. Обіймав посаду стрільця-кулеметника в 5-й окремій Слобожанській бригаді. Мав статус учасника бойових дій і ветерана війни.
«Сергій був людиною, яку неможливо ніким замінити. Він був світлою, доброю і сильною особистістю, справжнім захисником, який стояв на захисті до останнього. Поруч із ним завжди було спокійно – за ним нічого не страшно. Він залишив глибоку порожнечу в наших серцях», – розповіла сестра Світлана Запорожець.
За службу Сергія Прудкого нагородили орденом «За мужність» ІІІ ступеня.
Поховали захисника на Центральному кладовищі в селищі Зачепилівка Харківської області.
У нього залишилися мати, донька та сестра.
